Detalhe da pesquisa
1.
Introducing the Bacterial and Viral Bioinformatics Resource Center (BV-BRC): a resource combining PATRIC, IRD and ViPR.
Nucleic Acids Res
; 51(D1): D678-D689, 2023 01 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36350631
2.
A genomic data resource for predicting antimicrobial resistance from laboratory-derived antimicrobial susceptibility phenotypes.
Brief Bioinform
; 22(6)2021 11 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34379107
3.
The PATRIC Bioinformatics Resource Center: expanding data and analysis capabilities.
Nucleic Acids Res
; 48(D1): D606-D612, 2020 01 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31667520
4.
PATRIC as a unique resource for studying antimicrobial resistance.
Brief Bioinform
; 20(4): 1094-1102, 2019 07 19.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28968762
5.
A machine learning-based service for estimating quality of genomes using PATRIC.
BMC Bioinformatics
; 20(1): 486, 2019 Oct 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31581946
6.
Improvements to PATRIC, the all-bacterial Bioinformatics Database and Analysis Resource Center.
Nucleic Acids Res
; 45(D1): D535-D542, 2017 01 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27899627
7.
The SEED and the Rapid Annotation of microbial genomes using Subsystems Technology (RAST).
Nucleic Acids Res
; 42(Database issue): D206-14, 2014 Jan.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24293654
8.
PATRIC, the bacterial bioinformatics database and analysis resource.
Nucleic Acids Res
; 42(Database issue): D581-91, 2014 Jan.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24225323
9.
Real time metagenomics: using k-mers to annotate metagenomes.
Bioinformatics
; 28(24): 3316-7, 2012 Dec 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23047562
10.
Connecting genotype to phenotype in the era of high-throughput sequencing.
Biochim Biophys Acta
; 1810(10): 967-77, 2011 Oct.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21421023
11.
Accessing the SEED genome databases via Web services API: tools for programmers.
BMC Bioinformatics
; 11: 319, 2010 Jun 14.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-20546611
12.
The National Microbial Pathogen Database Resource (NMPDR): a genomics platform based on subsystem annotation.
Nucleic Acids Res
; 35(Database issue): D347-53, 2007 Jan.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-17145713
13.
The RAST Server: rapid annotations using subsystems technology.
BMC Genomics
; 9: 75, 2008 Feb 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-18261238
14.
Assembly, Annotation, and Comparative Genomics in PATRIC, the All Bacterial Bioinformatics Resource Center.
Methods Mol Biol
; 1704: 79-101, 2018.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29277864
15.
The subsystems approach to genome annotation and its use in the project to annotate 1000 genomes.
Nucleic Acids Res
; 33(17): 5691-702, 2005.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-16214803
16.
The ERGO genome analysis and discovery system.
Nucleic Acids Res
; 31(1): 164-71, 2003 Jan 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-12519973
17.
PATtyFams: Protein Families for the Microbial Genomes in the PATRIC Database.
Front Microbiol
; 7: 118, 2016.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26903996
18.
Reconstruction of the Regulatory Network for Bacillus subtilis and Reconciliation with Gene Expression Data.
Front Microbiol
; 7: 275, 2016.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27047450
19.
Enabling comparative modeling of closely related genomes: example genus Brucella.
3 Biotech
; 5(1): 101-105, 2015 Feb.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28324362
20.
RASTtk: a modular and extensible implementation of the RAST algorithm for building custom annotation pipelines and annotating batches of genomes.
Sci Rep
; 5: 8365, 2015 Feb 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25666585